Премии Правительства Российской Федерации 2006 года в области науки и техники постановлением Правительства Российской Федерации от 22 февраля 2007 г. № 121 присуждены:
академику Кулипанову Г.Н., докторам физико-математических наук Мезенцеву Н.А., Желудевой С.И., кандидату технических наук Медведко А.С., члену-корреспонденту РАН Ковальчуку М.В., начальнику СКБ Шилину Ю.Н. – за создание научно-технического комплекса на базе специализированных источников синхротронного излучения «Сибирь» в Российском научном центре «Курчатовский институт»;
члену-корреспонденту РАН Грехову И.В. – за комплекс работ по созданию и освоению производства нового поколения мощных тиристоров и диодов для энергоемких отраслей промышленности, энергетики и транспорта;
члену-корреспонденту РАН Абрамову С.М., старшему научному сотруднику Адамовичу А.И., ведущему инженеру-программисту Коваленко М.Р., ведущему инженеру Пономареву А.Ю., кандидату технических наук Шевчуку Ю.В., Айламазяну А.К. (посмертно) – за разработку конструкторской и программной документации, подготовку промышленного производства и выпуск образцов высокопроизводительных вычислительных систем (суперкомпьютеров) семейства «СКИФ» Ряда I и Ряда II;
академику Бугаеву А.С. – за создание информационно-аналитического комплекса мониторинга электронных сообщений в глобальных телекоммуникационных сетях;
академику Горячевой И.Г. – за создание и внедрение в машиностроение высокоресурсных крупногабаритных экологически чистых узлов трения скольжения с высокими триботехническими свойствами;
академику Миронову С.П. – за разработку приоритетов контроля патологических реакций организма в зависимости от длительного воздействия на биологически активные зоны кожи конечностей чрескостными металлическими конструкциями;
доктору физико-математических наук Степанову Е.В. – за разработку и внедрение в практику методов диагностики и лечения заболеваний, ассоциированных с инфекцией Helicobacter pylori, в целях улучшения здоровья населения Российской Федерации;
академику Коновалову А.Н. – за разработку и внедрение в практику комплекса методов реконструктивной и минимально инвазивной нейрохирургии при посттравматической патологии черепа и головного мозга в условиях мирного времени и военных конфликтов;
кандидатам медицинских наук Агурееву А.Н., Полякову В.В. – за комплекс научных исследований по разработке пищевых космических технологий, продуктов и рационов для питания космонавтов и их внедрение при осуществлении длительных космических полетов в ходе реализации Федеральной космической программы России;
академику Черешневу В.А., кандидату физико-математических наук Аптикаевой О.И., доктору физико-математических наук Гамбурцеву А.Г., члену-корреспонденту РАН Грачеву В.А., доктору технических наук Жалковскому Е.А., академику Летникову Ф.А., члену-корреспонденту РАН Юдахину Ф.Н. – за разработку и внедрение системного экологического мониторинга как компонента стратегической безопасности.